Результаты генетического повторного анализа привели к постановке диагноза более чем 500 пациентам

Европейский консорциум по решению неразрешенных редких заболеваний продемонстрировал важность международного сотрудничества для решения неудовлетворенных медицинских потребностей в диагностике редких заболеваний. Более 500 европейских пациентов с неизвестными заболеваниями получили диагнозы благодаря новым генетическим исследованиям. Это включает пациентов с редкими неврологическими заболеваниями, тяжелыми интеллектуальными нарушениями, мышечными заболеваниями и наследственным раком желудочно-кишечного тракта.

Эти диагнозы были установлены благодаря обширному европейскому сотрудничеству, возглавляемому исследователями из Университета Тюбингена, медицинского центра университета Радбуда и Национального центра геномного анализа в Барселоне. Заболевание считается редким в Европейском союзе, если оно встречается у менее пяти из 10 000 человек. Из 7 000 редких заболеваний не менее 70% имеют генетическую причину. Из-за того, что эти заболевания настолько редки, трудно точно определить их причину в ДНК, даже если несколько членов одной семьи страдают от этого заболевания. Теперь исследователи смогли поставить диагноз ряду европейских пациентов и семей с редким генетическим заболеванием. Это включает редкие неврологические расстройства, синдромы нарушений развития и интеллектуальные отклонения, редкие нейромышечные заболевания и подозрение на синдромы наследственного рака. В общей сложности исследователи повторно проанализировали существующие геномные данные 6 447 пациентов и 3 197 не затронутых заболеванием членов их семей. Благодаря этому исследованию 506 пациентов и их семьи получили диагнозы. У 15% пациентов есть перспективы для действий, включая лечение; в других случаях диагноз помогает прояснить ситуацию для пациентов и их семей. Эти результаты были опубликованы в журнале Nature Medicine.

Эти диагнозы стали возможны благодаря проекту Solve-RD, крупному европейскому сотрудничеству, включающему 300 экспертов из 12 европейских стран и Канады. Во главе с исследователями из Университета Тюбингена, медицинского центра университета Радбуда и Национального центра геномного анализа (CNAG) в Барселоне, эти эксперты провели тщательный повторный анализ генетических данных пациентов. Они работают в рамках Европейских референтных сетей (ERN), которые сосредоточены на определенных редких заболеваниях. Благодаря этой структуре теперь не имеет значения, где пациент с редким заболеванием обращается за помощью — в Нидерландах, Германии или Франции. Метод достижения диагноза теперь одинаков везде. Это не произошло без трудностей. Эксперты должны были согласовать методику анализа для каждого заболевания, например, какие гены и типы вариантов необходимо исследовать. Логистические проблемы, а также национальное законодательство и регламенты также сыграли важную роль.

Эта инициатива, основанная на двухуровневой экспертной системе повторного анализа данных проекта Solve-RD, предоставляет структурированный подход к диагностике и потенциальному лечению редких заболеваний. Система позволяет экспертам из различных областей, таких как клиническая генетика и науки о данных, проверять анализы, что повышает точность диагностики. Этот подход расширяется через Европейский альянс исследований редких заболеваний (ERDERA), новое партнерство в области редких заболеваний, координируемое INSERM во Франции, в котором участвуют более 180 организаций, включая ключевых ученых из Solve-RD. Один из целей ERDERA — ускорить диагностику пациентов с редкими заболеваниями. Сбор данных от более широкого круга пациентов и сотрудничество с дополнительными медицинскими центрами Европы позволят ERDERA предоставить диагнозы тем, кто еще не получил их, расширяя влияние исследований редких заболеваний. В рамках ERDERA Университет Тюбингена возглавляет направление клинических исследований, работая вместе с командами из Radboudumc, Барселоны и других стран Европы. Это включает расширение повторного анализа данных пациентов с 10 000 до более чем 100 000 наборов данных редких заболеваний и охват более широкого спектра редких генетических заболеваний. Работа также акцентирует внимание на использовании передовых методов, таких как секвенирование генома с длинными чтениями, оптическое картирование генома и секвенирование РНК для ускорения диагностики неразрешенных редких заболеваний.

Хольм Гресснер, координатор проекта Solve-RD, сказал: «Подход Solve-RD к повторному анализу данных пациентов с неразрешенными редкими заболеваниями оказался успешным и привел к постановке диагноза более чем 500 пациентам. Это важный шаг вперед и веха для исследований редких заболеваний в Европе. Мы продолжим и масштабируем этот подход в ERDERA, чтобы предоставить диагноз еще большему количеству пациентов и семей по всей Европе». Лисенка Виссерс, профессор трансляционной геномики и ведущий исследователь из Radboudumc, сказала: «Мы провели большой повторный анализ огромного количества данных пациентов. Это позволило нам найти схожести и сделать выводы. Мы даже смогли поставить диагноз пациенту, который болел на протяжении 20 лет и участвовал в многих исследованиях». Александр Хойшен, профессор геномных технологий для иммунных и инфекционных заболеваний и ведущий исследователь из Radboudumc, сказал: «Тот факт, что мы достигли этого, является уникальным примером силы сотрудничества. Это огромный шаг вперед в европейском сотрудничестве, и это только начало.

Хотя мы пока не сделали новых открытий и эти диагнозы получены на основе существующих данных и анализов, мы надеемся, что в ближайшие годы сможем помочь многим другим пациентам. Изначально с помощью постановки диагноза, а в будущем — возможно, и с лечением».