По прошествии всего нескольких недель после опубликования результатов исследования ОПЕРА, они стали предметом активных споров в научном сообществе. Согласно результатам, мюонное нейтрино способно превысить скорость света. В этой связи появились новые научные теории, объясняющие неверность полученных в ходе исследования данных. На сегодняшний день только две из них выглядят правдоподобно.
Первая теория британского ученого Карло Контальди заявляет о том, что учеными ОПЕРА не учтена сила гравитации, и ее воздействие на часы ведения отсчета времени в исследовании. Учитывая то, что показатель гравитационной силы различался между станцией, расположенной в Италии и станцией в Женеве, то одни часы шли быстрее других, что исказило измерения. Если это так, то это достаточно тривиальная ошибка ставит команду ОПЕРА в очень неловкое положение.
Второе предположение Эндрю Коген и Шелдона Глэшоу указывает, что при движении нейтрино с указанной скоростью должны излучаться частицы, оставляющие след, который можно измерить. Поскольку ОЕРА не сообщала об этих следах, следовательно, в действительности нейтрино не двигалось с указанной скоростью. Однако пока ни одна из теорий окончательно не опровергает результатов исследования команды ОПЕРА.
